Cytoscape یک بستر نرم افزاری منبع باز برای تجسم شبکه های پیچیده و ادغام آنها با هر نوع داده ویژگی است.افزونه های زیادی برای انواع مختلف دامنه های مشکل از جمله بیوانفورماتیک ، تجزیه و تحلیل شبکه های اجتماعی و وب معنایی در دسترس است.Cytoscape بسیاری از موارد استفاده را در زیست شناسی مولکولی و سیستم ها ، ژنومیک و پروتئومیک پشتیبانی می کند: بارگیری مجموعه داده های تعامل مولکولی و ژنتیکی در بسیاری از قالب ها پروژه و یکپارچه سازی مجموعه داده های جهانی و حاشیه نویسی های کاربردی ایجاد نقشه های بصری قدرتمند در بین این داده ها تجزیه و تحلیل پیشرفته و مدل سازی را با استفاده از افزونه های Cytoscape تجسم کنید.و تجزیه و تحلیل داده های مجموعه داده های مسیر انسانی مانند Reactome یا KEGG.